La régulation de la transpiration des plantes par leurs stomates est considérée comme un facteur clé de la résistance à la sécheresse par les écophysiologistes. Les études actuelles considèrent souvent qu’en cas de sécheresse, le xylème, tissu qui conduit la sève brute vers les feuilles, est le facteur limitant. Sa vulnérabilité à la cavitation, c’est-à-dire à rompre la colonne d’eau qui doit approvisionner les cellules pour réaliser la photosynthèse, est d’ailleurs souvent évoquée lorsqu’on parle de résistance à la sécheresse.
Des chercheurs ont cependant montré que l’interaction entre le sol et les racines est un facteur important du statut hydrique des plantes, bien qu’il soit encore peu connu, tant il est difficile à mesurer. Des résultats récents ont mis en évidence que la transpiration ou plutôt son arrêt en cas de sécheresse, n’est pas uniquement due aux caractéristiques propres des plantes (capacité à stopper leur transpiration). Les racines adaptent leur conductivité mais également celle du sol à proximité, la rhizosphère, pour correspondre à la demande atmosphérique en eau, ce qui contribue à la régulation de la transpiration.