En 1998 débuta une des crises majeures à laquelle la hêtraie ardennaise dû faire face. Un coup de gel brutal après des températures automnales douces, provoqua une nécrose du cambium. Cela attira différentes espèces de scolytes, apportant avec eux des spores de champignons lignivores qui attaquèrent les arbres affaiblis, provoquant la mort d’un nombre important de hêtres. Plus d’un million de mètres cubes de bois furent touchés par ce phénomène qui fut appelé, à tort, « maladie du hêtre ». Un dispositif de monitoring fût mis en place dès l’année 2000, ayant pour objectifs de déterminer l’évolution des symptômes et les indices précurseurs à leur apparition. Le suivi à long terme de ce dispositif, ainsi que les données de l’IPRFW à une échelle plus large, ont montré la dynamique du phénomène et permettent d’affirmer que la crise sanitaire est bel et bien terminée. Cependant, depuis 2008, les données de l’IPRFW mettent en évidence que l’état sanitaire des hêtraies se détériore, sans que l’on puisse en identifier les causes.